BACE-2isanasparticproteasethatsharessequencesimilaritywithBACE-1,themajorβ-secretaseforgenerationofAβpeptideinneurons.However,BACE-2differsfromBACE-1inseveralaspectsincludingpro-enzymeactivation,substratebindingsites,transcriptionalregulation,andfunctioninAβpeptideproduction.ThedomainstructureofmouseBACE-2consistsofasignalpeptide(aa1-19),pro(aa20-62)andamaturechain(aa63-514)thatconsistsatransmembranedomainandacytoplasmictail.TheC-terminalregion(aa463-514)wasreplacedbyaHistaginthermBACE-2thatalsocontainedaHisresidueatthepositionofTyr357.ThepurifiedrmBACE-2startedatAla63,thesameresidueshownattheN-terminusofthehumanactiveBACE-2.
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